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[39일차] 프로그래밍 & 수학 책 정리 01 : 딥러닝을 위한 수학 안녕하세요, 이번엔 최근에 완독한 '딥러닝을 위한 수학' 책을 정리해보려고 합니다.   본 책은 수학책이면서 수학을 프로그래밍으로 구현하며 여러 심층학습 개념들을 소개해주는 게 좋았는데요. 물론 기본을 다룬 책이긴 하지만, 저에겐 꽤 어렵더군요. 수학은 역시 쉽지 않은 것 같습니다. 우선 딥러닝(심층학습)이란 무엇일까요? 딥러닝은 '인공신경망'을 기반으로 데이터로부터 특징을 추출하고, 특징 간의 패턴을 학습하여 판단 및 예측하는 기술이라고 볼 수 있습니다. 이는 특징이 주어지면 그로부터 패턴을 학습하여 판단 및 예측하는 고전적인 머신러닝과는 차이가 있죠.  그렇다면 '인공신경망'은 무엇일까요? ANN(Artificial Neural Network)라고도 불리는 '인공 신경망'은 인간의 뇌와 유사한 계층 .. 더보기
[37일차] 오픈소스 논문 리뷰 연습 03 :: Causal effects of gut microbiota on sepsis and sepsis-related death: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA, bulk RNA sequencing, and network pharmacology 안녕하세요, 이번 글에서는 장내미생물이 패혈증에 미치는 causal effects에 대해 분석한 논문을 정리해보도록하겠습니다.   Causal effects of gut microbiota on sepsis and sepsis-related death: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cBackground Gut microbiota alterations have been implicated in sepsis and related infectious diseases, but the causal relationship and underlying mechanisms remain unclear. Methods We evaluated the .. 더보기
[36일차] 챗GPT 딥리서치 정리 01 :: 2020년대 이후 단일세포 RNA 시퀀싱 분야의 최신 연구 동향 이번 글에서는 최근에 사용할 수 있게된 '챗GPT 딥리서치'를 활용해 파악한 scRNA-seq 최신 동향 내용을 정리해보고자 합니다. 말 그대로 챗GPT가 정리한 거라서 오류가 있을 수 있습니다!   챗GPT가 어떻게 답변했는지는 아래 링크에 담겨있습니다. 그대로 적으며 정리해볼 예정입니다.   ChatGPT - scRNA-seq 최신 동향Shared via ChatGPTchatgpt.com  우선, " 2020년 이후부터 학계에서의 scRNA-seq 분야의 주요 최신 동향을 정리해줘"라고 물어봤는데요. 그랬더니 어떤 부분에 초점을 두고자 하는지 물어보더군요.   그래서 그냥 전체 분야에서 깊이 있는 정리 즉, 상세한 리뷰를 원한다고 했습니다.    기다리고 나니, 어떤 출처를 참고했는지와 함께 '202.. 더보기
[35일차] 논문 결과 읽기 전, 초록 서론 정리 :: Causal effects of gut microbiota on sepsis and sepsis-related death: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA, bulk RNA sequencing, and network pharmacology 안녕하세요, 이번 글에서는 새로운 논문을 본격적으로 정독해서 읽기 전에 서론 초록 먼저 간단하게 정리해보려고 합니다.  이번에 읽고 있는 논문 제목은 "Causal effects of gut microbiota on sepsis and sepsis-related death: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA, bulk RNA sequencing, and network pharmacology"로 2024년 초에 저널 'Journal of Translational Medicine'에 실린 논문입니다.     Causal effects of gut microbiota on sepsis and sepsis-related dea.. 더보기
[34일차] 뉴욕타임스 과학 기자가 쓴 면역학 책 리뷰, 우아한 방어 (우리 몸을 지키는 면역학의 놀라운 비밀) 안녕하세요, 이번 글에서는 최근에 재밌게 읽은 책인 '우아한 방어(An Elegant Defense)'를 가볍게 정리해보고자 합니다.    본 책의 저자는 '맷 릭텔'로 캘리포니아 대학교에서 저널리즘 석사 학위를 받은 후 뉴욕 타임스에서 과학기자로 일하며 면역 항암제와 같은 과학, 기술 분야에 다양한 기사를 써왔다고 합니다.    Matt Richtel - The New York TimesMatt Richtel is a health and science reporter for The Times, based in Boulder, Colo.www.nytimes.com  저는 번역본을 읽었고 홍경탁 번역자 분께서 본 책을 번역해주셨습니다. 맷 릭텔이 집필한 '우아한 방어'라는 책은 면역학 상식들을 쉽고 재밌게.. 더보기
[33일차] 오픈엑세스 논문 리뷰 연습 02 :: Single-cell analyses and host genetics highlight the role of innate immune cells in COVID-19 severity 안녕하세요, 오늘은 전 글처럼 최근에 공부 겸 읽어본 또 다른 오픈엑세스 논문을 간단하게 정리해보고자 합니다.  [32일차] 오픈엑세스 논문 리뷰 연습 01 :: Integrating single-cell sequencing data with GWAS summary statistics revea이번 글에서는 최근에 관심있게 읽은 논문 한 편을 정리해보려고 합니다. 제목은 'Integrating single-cell sequencing data with GWAS summary statistics reveals CD16+monocytes and memory CD8+T cells involved in severe COVID-19'로tkmstudy.tistory.com 최근에 전에 정리한 논문에서의 연구 프로세.. 더보기
[32일차] 오픈엑세스 논문 리뷰 연습 01 :: Integrating single-cell sequencing data with GWAS summary statistics reveals CD16+monocytes and memory CD8+T cells involved in severe COVID-19 이번 글에서는 최근에 관심있게 읽은 논문 한 편을 정리해보려고 합니다. 제목은 'Integrating single-cell sequencing data with GWAS summary statistics reveals CD16+monocytes and memory CD8+T cells involved in severe COVID-19'로 2022년 Genome Medicine 저널에 퍼블리쉬된 오픈 엑세스 논문입니다.  Integrating single-cell sequencing data with GWAS summary statistics reveals CD16+monocytes and memory CD8+T cells involved in sBackground Understanding the host.. 더보기
[31일차] 생물학 전공자를 위한 오래된 유튜브 추천, z집사TV(ZipsaTV) 이번 글에서는 최근에 유익하게 보고 있는 유튜브를 잠깐 소개해드리려고 합니다. 바로 'z집사TV(ZipsaTV)'입니다!  z집사TV (ZipsaTV)면역학 + 암생물학 + 신약개발 관련 영상이 비정기적으로 업로드 됩니다. 냐옹! 영상의 난이도: ⭐⭐⭐ 관련 전공 학부생 고학년 혹은 석박사 저학년 ⭐⭐ 관련 전공 학부생 및 생물학에 관심 많www.youtube.com   유튜브에 들어가면 이렇게 면역학 내용을 전공 수준에서 쉽고 재밌게 전달해주셔서 공부하기 좋은 듯 합니다.    이외에도 바이오 전공자를 위한 다양한 내용들이 유튜브에 있는 듯 한데 시간 될 때마다 하나씩 봐두어야 겠습니다.    요즘 대학원 준비 겸 이런 유튜브로 전공 지식 공부도 하면서 관련 논문들도 읽고 있는데요, 내용들을 비공개로 .. 더보기

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