생물정보학(바이오인포매틱스)/생물정보학 책 썸네일형 리스트형 [생물정보학 알고리듬 4장] 펩티드를 어떻게 추론할 수 있을까? :: 실험 스펙트럼과 이론 스펙트럼, 그리고 컨볼루션 안녕하세요 TKM입니다! 우선, 글을 시작하기 전에 본 글은 공부 목적의 글로 오류가 많이 있을 수 있음을 밝힙니다 🙏 더보기 [생물정보학 알고리듬 4장] '항생제 내성 세균'에 대응하기 위한 '항생제 펩티드 아미노산 순서' 알아내기 안녕하세요, 생물정보학도 TKM입니다! 오늘 다룰 책 4장의 주제는 '항생제 서열을 어떻게 알아낼까?'입니다. '약학용어사전'에 따르면, '항생제'란 "미생물이 생성한 물질로, 다른 미생물의 성장을 저해하여 항균작용을 나타내며 인체에 침입한 세균의 감염을 치료한다"1)고 합니다. 그렇지만 미생물도 거대한 역사 속에서 우리와 함께 살아남은 '생명체'인 만큼, 그간 나름의 진화를 거듭해왔을 나쁜 미생물을 없애는 건 쉽지 않을 것입니다..! 이처럼 제약회사의 항생제 개발에 맞서 병원성 박테리아는 '항생제 내성'을 갖게 되었습니다. 전에 동그라미재단 인터뷰 글에서 서울대 의과대학 의과학과 염진기 교수님이 "2050년에는 항생제 내성 세균 감염에 의한 사망자가 전세계적으로 천만명으로 이를 것으로 예상되지만, 아직.. 더보기 [생물정보학 알고리듬 03장] 컨티그 조립하기(최대 비분기 경로) & DNA array와 트랜스포존(transposon) 안녕하세요, 과학커뮤니케이터 TKM입니다! 이번엔 지난 번 글에 이어 생물정보학 알고리듬 3장 내용을 정리해보겠습니다 👏 [생물정보학 알고리듬 3장] '리드(read)'로부터 유전체 뉴클레오티드 서열 조립하기 :: 드 브루인 안녕하세요 TKM입니다! 그동안 영어 공부겸 '생물정보학 알고리듬' 책 내용을 영어로 한 챕터씩 정리해왔는데 그러다보니 제가 제대로 내용을 쓰고 있는지, 그리고 제대로 공부가 되고 있는건지 tkmstudy.tistory.com 우선, 드 브루인 그래프의 한계에서부터 시작해보겠습니다 :) 예로, 리드의 길이를 3이 아닌 2로 잡으면 다음과 같이 드브루인 그래프가 겹치는게 많아져 복잡해집니다..! 따라서 생물학자들은 리드의 길이를 늘릴 수 있는 방법을 고안해냈다고 합니다 🙋♂️ 즉, .. 더보기 [생물정보학 알고리듬 3장] '리드(read)'로부터 유전체 뉴클레오티드 서열 조립하기 :: 드 브루인 그래프, 해밀턴 경로, 오일러 경로 안녕하세요 TKM입니다! 그동안 영어 공부겸 '생물정보학 알고리듬' 책 내용을 영어로 한 챕터씩 정리해왔는데 그러다보니 제가 제대로 내용을 쓰고 있는지, 그리고 제대로 공부가 되고 있는건지 잘 모르겠어서 ㅋㅋㅋ 그래서 이젠 영어공부는 다른 걸로 하기로 했고, 책 정리는 익숙한 한글로 하기로 했습니다! 책 내용이 인용되는 만큼 만약 문제 되는 부분이 있다면, 아래 메일로 피드백 주시면 조치하도록 하겠습니다 🙏 E-mail: tkm1214@naver.com 유전체 서열을 어떻게 밝힐 수 있을까? 유전체(genome)를 화학적 방법으로 산산조각내었다고 가정해봅시다! 이때 발생한 작은 DNA 조각을 '리드(read)'라고 하는데, 여기서 겹쳐지는 조각들을 파악해서 유전체의 뉴클레오티드 서열을 조립하는 것을 ' .. 더보기 [Bioinformatics Algorithms Ch 02] Circadian Clock and Regulatory Motifs Hi, I'm a TKM. I will discuss Chapter 2 in the book today. The topic is "Which DNA Patterns Play the Role of Molecular Clocks?". In summary, plants can regulate their transcription by employing specific factors that control gene expression through the binding of particular DNA regions known as motifs. The motif is the specific short DNA region that is placed at the start of the genes. The author.. 더보기 [Bioinformatics Algorithms Ch 01] The algorithm of DNA Replication Hi I'm a TKM. Today, I will introduce some algorithms in Chapter 1 of "Bioinformatics Algorithms". FREQUENTWORDS If you want to create a 4-mer pattern, the number of possible patterns would be 4 x 4 x 4 x 4. 1) And if the sequence is "ACGACGACA", 4-mer pattern can be narrowed to 6 patterns: ACGA, CGAC, GACG, ACGA, CGAC, GACA Then, the most frequent sequence is 'CGAC' and 'ACGA'. 2) And if the se.. 더보기 [Bioinformatics Algorithms Ch 01] The story of DNA Replication Hi! I'm a science communicator, TKM. Today, I'll talk about scientific stories from the book 'Bioinformatics Algorithms'. This book may be beneficial for students like me. This is because it can be an effective way to gain knowledge of bioinformatics and encourage algorithmic thinking. To begin, I'll discuss Chapter 01 of 'Bioinformatice Algorithms' today. If you find any errors or mistakes in t.. 더보기 이전 1 다음
