생물정보학(바이오인포매틱스) 썸네일형 리스트형 [30일차] 논문 간단 소개 :: 장내 미생물이 면역계, 그리고 궤양성 대장염(ulcerative colitis)에 미치는 영향 이번 글에서는 어제 읽은 논문인 'Integrative analysis of single-cell RNA-seq and gut microbiome metabarcoding data elucidates macrophage dysfunction in mice with DSS-induced ulcerative colitis(2024)'에서 흥미롭게 다가왔던 부분 몇 가지만 살짝 정리하고 가겠습니다. 특히 제가 졸업논문으로 장내미생물(GM) 관련 SNP 데이터로 장내미생물 사이의 상호 연관성을 분석하는 연구를 진행해본지라 더 흥미롭게 다가왔네요. 제 졸업논문에서는 알츠하이머병(AD) 유발과 연관된 장내미생물(AD risk GM)인 bactroides와 불면증(insomnia)에 positive casual ef.. 더보기 [29일차] CellTypist :: scRNA-seq, cell-type annotation 자동화 툴 이번 글에선 최근에 개별세포분석 리뷰논문을 읽으면서 관련 툴들을 노션에 정리하다 찾게 된 흥미로운 툴인 CellTypist에 대해 소개해보겠습니다. 대학원 준비생의 노트 ( 24. 12 ~ ) | Notion'과학커뮤니케이터 TKM' TKM's STUDY BLOGsparkling-dibble-7ff.notion.site CellTypist는 자동화된 cell type annotation을 위한 open source tool로 다음과 같은 working group에 해당 모델을 개발했다고 합니다. 한국인 분도 계신 듯 하여 반갑네요. 아래는 CellTypist 플랫폼 링크입니다. Automated cell type annotation for scRNA-seq datasetsCellTypist .. 더보기 [28일차] Azimuth, reference-base single-cell analysis를 위한 앱 제가 최근에 single cell 분석 관련 공부를 하고자 노션 홈페이지에 다가 공부하면서 찾은 관련 툴과 공부 자료들을 정리해 모아두고 있는데요. 대학원 준비생의 노트 ( 24. 12 ~ ) | Notion'과학커뮤니케이터 TKM' TKM's STUDY BLOGsparkling-dibble-7ff.notion.site 이번 글에서는 그중 흥미로웠던 앱 중 하나인 referenc-based single-cell analysis를 위한 앱인 Azimuth를 소개해보고자 합니다. AzimuthAzimuth: An app for reference-based single-cell analysisazimuth.hubmapconsortium.org "Azimuth is a web application .. 더보기 [27일차] Git & Github 기초 공부 06 :: 깃허브 원격 저장소와 로컬 저장소 연결, remote + push & pull 이번 글에서도 저번 글에 이어 유노코딩 유튜브 학습 내용을 복습해보고자 합니다. 이번 주제는 '깃허브 원격 저장소'로 마지막 주제가 되겠습니다. [27일차] Git & Github 기초 공부 05 :: 브랜치 관리하기 :: 실험용 브랜치 생성, 병합, 제거까지이번 글에서는 저번 글에 이어 유노코딩 7강 브랜치 관리하기 강의 들은 내용을 복습해보도록 하겠습니다. [27일차] Git & Github 기초 공부 04 :: 스테이징 혹은 커밋 실수 대응 방법, git reset & retkmstudy.tistory.com 강의에서 설명하길, 깃허브(Github)란 깃 저장소 호스팅을 지원하는 웹 서비스로, 이렇게 온라인 상에 원격 저장소를 만들어 그래픽 인터페이스를 기반으로 관리할 수 있다고 합니.. 더보기 [27일차] Git & Github 기초 공부 05 :: 브랜치 관리하기 :: 실험용 브랜치 생성, 병합, 제거까지 이번 글에서는 저번 글에 이어 유노코딩 7강 브랜치 관리하기 강의 들은 내용을 복습해보도록 하겠습니다. [27일차] Git & Github 기초 공부 04 :: 스테이징 혹은 커밋 실수 대응 방법, git reset & revert이번 글에서는 전에 이어 깃 관련 공부, 그 중에서도 실수 대응 방법을 복습해보겠습니다. [27일차] Git & Github 기초 공부 03 :: .gitignore로 특정 파일을 버전 관리에서 제외 하기이번 글에서는 전tkmstudy.tistory.com 우선 git의 branch가 무엇인지부터 알아보죠. 역시 챗GPT에게 물어봤습니다. 정리하자면, Git의 브랜치(branch)는 같은 프로젝트 내에서 독립적으로 작업할 수 있는 분리된 작업 영역으로, 기존 .. 더보기 [27일차] Git & Github 기초 공부 04 :: 스테이징 혹은 커밋 실수 대응 방법, git reset & revert 이번 글에서는 전에 이어 깃 관련 공부, 그 중에서도 실수 대응 방법을 복습해보겠습니다. [27일차] Git & Github 기초 공부 03 :: .gitignore로 특정 파일을 버전 관리에서 제외 하기이번 글에서는 전 글에 이어서 유노코딩 YOUTUBE에서 공부한 git 관련 내용을 복습해보겠습니다. [27일차] Git & Github 기초 공부 02 :: 파일을 Working Directory에서 Staging Area, Repository까지 이동시키기전tkmstudy.tistory.com 먼저 실수로 git add 명령어를 입력해 working directory에서 staging area 보낸 파일의 경우, $ git reset으로 다시 working directory로 보낼 수 있습.. 더보기 [27일차] Git & Github 기초 공부 03 :: .gitignore로 특정 파일을 버전 관리에서 제외 하기 이번 글에서는 전 글에 이어서 유노코딩 YOUTUBE에서 공부한 git 관련 내용을 복습해보겠습니다. [27일차] Git & Github 기초 공부 02 :: 파일을 Working Directory에서 Staging Area, Repository까지 이동시키기전 글에 이어서 유노코딩을 통해 공부한 Git 관련 내용을 복습해보겠습니다. [27일차] Git & Github 기초 공부 01 :: 유노코딩 YOUTUBE, 깃 설치부터 기본 깃 명령어 실습까지이번 글에서는 최근에 유노tkmstudy.tistory.com 이번 글에서 정리할 건 먼저 깃 설정 파일 '.gitignore'입니다. .gitignore는 언제 사용할까요? 챗GPT에게 물어봅시다. 챗GPT가 말하길, .gitignore 파일.. 더보기 [27일차] Git & Github 기초 공부 02 :: 파일을 Working Directory에서 Staging Area, Repository까지 이동시키기 전 글에 이어서 유노코딩을 통해 공부한 Git 관련 내용을 복습해보겠습니다. [27일차] Git & Github 기초 공부 01 :: 유노코딩 YOUTUBE, 깃 설치부터 기본 깃 명령어 실습까지이번 글에서는 최근에 유노코딩 YOUTUBE "깃과 깃허브가 처음인 당신에게" 콘텐츠 총 8강을 다 들어서, 본 강의에서 배운 내용에 대해 복습을 해보고자 합니다. 챗GPT가 말하길, 깃(git)은 분산 tkmstudy.tistory.com 전에 만든 git_practice의 text1.txt 파일을 열어서 아무 말이나 적어봅시다. 파일을 수정하고 저장소에 보내지 않았으니, $ git status를 입력하면 "저장소로 보내야 할 즉, 커밋해야 할 수정한 기록이 있는 파일이 있다"라는 식의 말이 나올겁.. 더보기 이전 1 2 3 4 ··· 10 다음
