생물정보학(바이오인포매틱스) 썸네일형 리스트형 [42일차] 논문 리뷰 연습 04 :: PKM2 Drives Hepatocellular Carcinoma Progression by Inducing Immunosuppressive Microenvironment 안녕하세요, 이번엔 2023년 말에 전공수업에서 공부하고 리뷰 발표했던 논문을 다시 한번 정리해보려고 합니다. 논문 제목은 'PKM2 Drives Hepatocellular Carcinoma Progression by Inducing Immunosuppressive Microenvironment'로, 2020년에 개재된 논문이었습니다. PKM2 Drives Hepatocellular Carcinoma Progression by Inducing Immunosuppressive Microenvironment - PMCAbstract Background and Aims Pyruvate kinase M2 (PKM2) is an essential regulator of the Warburg effect, .. 더보기 [41일차] 생물정보학 입문 책 정리 Ch. 01 :: 서론 안녕하세요 이번 글에선 최근에 공부하고 있는 '생물정보학 입문 제 2판' 책 첫 챕터를 정리해보고자 합니다. 본 내용에는 오류가 있을 가능성이 있으며, 자세하고 정확한 내용은 본 책 1)을 참고하시길 추천드립니다! 우선 책의 인트로 부분에 다음과 같은 인상적인 문장이 있었습니다. 유전자 발현 패턴 그리고 조절 상호작용 네트워크는 세포와 생명체가 DNA에 담긴 정보를 어떻게 구현하는지 보여준다. 생명체의 잠재력은 게놈에 포함되어 있지만, 그것으로부터 생애 전반을 추론하는 것은 불가능하다. 생명 활동 전체를 이해하기 위해서는 RNA와 단백질, 그리고 이들이 DNA와 상호작용하는 방식을 찾아야 하는데, 이러한 활동은 발달 프로그램이나 환경에 따라 달라지고 반응한다. 1) 우리 몸이 만들어가는 이야기는 단.. 더보기 [40일차] 프로그래밍 & 수학 책 정리 02 : 딥러닝을 위한 수학 이번 글에서는 저번 글에 이어 '딥러닝을 위한 수학' 책 정리를 해보겠습니다. [39일차] 프로그래밍 & 수학 책 정리 01 : 딥러닝을 위한 수학안녕하세요, 이번엔 최근에 완독한 '딥러닝을 위한 수학' 책을 정리해보려고 합니다. 본 책은 수학책이면서 수학을 프로그래밍으로 구현하며 여러 심층학습 개념들을 소개해주는 게 좋았는tkmstudy.tistory.com 7번째 챕터에서는 심층학습에서 중요한 '미분'이라는 개념에 대해 설명합니다. 심층학습에서 미분은 신경망을 학습시킬 때 경사하강법을 이용해 신경망의 가중치들을 갱신하기 위해, 역전파 알고리즘으로 도함수를 구할 때 사용됩니다. 이때, 곡선의 점 x에서의 접선의 기울기를 x에서의 도함수(serivative)라고 하죠. 직관적으로, 도함수는 함수가.. 더보기 [39일차] 프로그래밍 & 수학 책 정리 01 : 딥러닝을 위한 수학 안녕하세요, 이번엔 최근에 완독한 '딥러닝을 위한 수학' 책을 정리해보려고 합니다. 본 책은 수학책이면서 수학을 프로그래밍으로 구현하며 여러 심층학습 개념들을 소개해주는 게 좋았는데요. 물론 기본을 다룬 책이긴 하지만, 저에겐 꽤 어렵더군요. 수학은 역시 쉽지 않은 것 같습니다. 우선 딥러닝(심층학습)이란 무엇일까요? 딥러닝은 '인공신경망'을 기반으로 데이터로부터 특징을 추출하고, 특징 간의 패턴을 학습하여 판단 및 예측하는 기술이라고 볼 수 있습니다. 이는 특징이 주어지면 그로부터 패턴을 학습하여 판단 및 예측하는 고전적인 머신러닝과는 차이가 있죠. 그렇다면 '인공신경망'은 무엇일까요? ANN(Artificial Neural Network)라고도 불리는 '인공 신경망'은 인간의 뇌와 유사한 계층 .. 더보기 [37일차] 오픈소스 논문 리뷰 연습 03 :: Causal effects of gut microbiota on sepsis and sepsis-related death: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA, bulk RNA sequencing, and network pharmacology 안녕하세요, 이번 글에서는 장내미생물이 패혈증에 미치는 causal effects에 대해 분석한 논문을 정리해보도록하겠습니다. Causal effects of gut microbiota on sepsis and sepsis-related death: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cBackground Gut microbiota alterations have been implicated in sepsis and related infectious diseases, but the causal relationship and underlying mechanisms remain unclear. Methods We evaluated the .. 더보기 [36일차] 챗GPT 딥리서치 정리 01 :: 2020년대 이후 단일세포 RNA 시퀀싱 분야의 최신 연구 동향 이번 글에서는 최근에 사용할 수 있게된 '챗GPT 딥리서치'를 활용해 파악한 scRNA-seq 최신 동향 내용을 정리해보고자 합니다. 말 그대로 챗GPT가 정리한 거라서 오류가 있을 수 있습니다! 챗GPT가 어떻게 답변했는지는 아래 링크에 담겨있습니다. 그대로 적으며 정리해볼 예정입니다. ChatGPT - scRNA-seq 최신 동향Shared via ChatGPTchatgpt.com 우선, " 2020년 이후부터 학계에서의 scRNA-seq 분야의 주요 최신 동향을 정리해줘"라고 물어봤는데요. 그랬더니 어떤 부분에 초점을 두고자 하는지 물어보더군요. 그래서 그냥 전체 분야에서 깊이 있는 정리 즉, 상세한 리뷰를 원한다고 했습니다. 기다리고 나니, 어떤 출처를 참고했는지와 함께 '202.. 더보기 [35일차] 논문 결과 읽기 전, 초록 서론 정리 :: Causal effects of gut microbiota on sepsis and sepsis-related death: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA, bulk RNA sequencing, and network pharmacology 안녕하세요, 이번 글에서는 새로운 논문을 본격적으로 정독해서 읽기 전에 서론 초록 먼저 간단하게 정리해보려고 합니다. 이번에 읽고 있는 논문 제목은 "Causal effects of gut microbiota on sepsis and sepsis-related death: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA, bulk RNA sequencing, and network pharmacology"로 2024년 초에 저널 'Journal of Translational Medicine'에 실린 논문입니다. Causal effects of gut microbiota on sepsis and sepsis-related dea.. 더보기 [34일차] 뉴욕타임스 과학 기자가 쓴 면역학 책 리뷰, 우아한 방어 (우리 몸을 지키는 면역학의 놀라운 비밀) 안녕하세요, 이번 글에서는 최근에 재밌게 읽은 책인 '우아한 방어(An Elegant Defense)'를 가볍게 정리해보고자 합니다. 본 책의 저자는 '맷 릭텔'로 캘리포니아 대학교에서 저널리즘 석사 학위를 받은 후 뉴욕 타임스에서 과학기자로 일하며 면역 항암제와 같은 과학, 기술 분야에 다양한 기사를 써왔다고 합니다. Matt Richtel - The New York TimesMatt Richtel is a health and science reporter for The Times, based in Boulder, Colo.www.nytimes.com 저는 번역본을 읽었고 홍경탁 번역자 분께서 본 책을 번역해주셨습니다. 맷 릭텔이 집필한 '우아한 방어'라는 책은 면역학 상식들을 쉽고 재밌게.. 더보기 이전 1 2 3 4 5 6 ··· 13 다음
