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[51일차] 암(cancer)과 장내 미생물 : 암의 원인 및 종류, Fusobacterium nucleatum, 그리고 Anti PD-1 therapy 안녕하세요, 이번에도 질병과 장내 미생물 간의 관계에 대해 다루는 글을 작성해보고자 합니다.   [49일차] 당뇨병(diabetes mellitus)과 장내미생물 : 제1형 당뇨병, 제2형 당뇨병안녕하세요, 이번 글에선 저번 글에 이어 '질병과 장내미생물'에 대한 내용을 정리해보고자 합니다.  [48일차] 개요, 장내 미생물과 숙주 면역계 간의 상호작용에 대하여 (+ 항생제의 위험성)안tkmstudy.tistory.com  [50일차] 감염 및 염증성 질환과 장내 미생물 : Clostridioides difficile, SARS-CoV-2, IBD(Inflammatory Bowel Diseas안녕하세요, 이번 글에선 저번 '당뇨병과 장내 미생물'에 대해 다룬 글에 이어 '감염 및 염증성 질환과 장내 미생.. 더보기
[50일차] 감염 및 염증성 질환과 장내 미생물 : Clostridioides difficile, SARS-CoV-2, IBD(Inflammatory Bowel Disease) 안녕하세요, 이번 글에선 저번 '당뇨병과 장내 미생물'에 대해 다룬 글에 이어 '감염 및 염증성 질환과 장내 미생물'에 대해 다뤄보겠습니다. [49일차] 당뇨병(diabetes mellitus)과 장내미생물 : 제1형 당뇨병, 제2형 당뇨병안녕하세요, 이번 글에선 저번 글에 이어 '질병과 장내미생물'에 대한 내용을 정리해보고자 합니다. [48일차] 개요, 장내 미생물과 숙주 면역계 간의 상호작용에 대하여 (+ 항생제의 위험성)안tkmstudy.tistory.com 1. 감염성 질환과 장내 미생물 감염(infection)은 병원체(세균), 바이러스 등의 미생물이 우리 몸에 들어와서 그 수가 많아지는 것1)을 말합니다. 그렇게 미생물에 의해 감염되어 나타나는 질환을 '감염병(infectious d.. 더보기
[49일차] 당뇨병(diabetes mellitus)과 장내미생물 : 제1형 당뇨병, 제2형 당뇨병 안녕하세요, 이번 글에선 저번 글에 이어 '질병과 장내미생물'에 대한 내용을 정리해보고자 합니다.  [48일차] 개요, 장내 미생물과 숙주 면역계 간의 상호작용에 대하여 (+ 항생제의 위험성)안녕하세요, 오늘은 장내미생물과 숙주 면역계 간의 상호작용 양상 및 분석 툴에 대해 다룬 자료 및 논문들의 내용을 정리해보고자 하는데요. 내용이 길어질 것 같아 몇 가지 주제로 나눠 시리tkmstudy.tistory.com    전 글에서 말했듯 장내 미생물들은  장 환경에서 장의 점막층, 상피세포, 면역세포 등과 역동적인 상호작용을 하고 있습니다. 그만큼 장내 미생물의 불균형 상태에 이르게 되면 당뇨병, 감염 및 염증성 질환, 암, 자가면역질환, 만성신장질환, 뇌질환 등 각종 다양한 몸의 기능 문제를 발생시킬 수 .. 더보기
[48일차] 개요, 장내 미생물과 숙주 면역계 간의 상호작용에 대하여 (+ 항생제의 위험성) 안녕하세요, 오늘은 장내미생물과 숙주 면역계 간의 상호작용 양상 및 분석 툴에 대해 다룬 자료 및 논문들의 내용을 정리해보고자 하는데요. 내용이 길어질 것 같아 몇 가지 주제로 나눠 시리즈로 작성해보고자 합니다. 논문을 주로 참고하긴 했지만 장내미생물과 숙주 면역계 간의 상호작용은 굉장히 복잡하고 아직 명확히 밝혀지지 않은 부분이 많은 듯 합니다. 그만큼 관련 내용을 이해함에 있어 제 배경지식과 경험의 한계가 있기에 오류가 많이 있을 수 있다는 점 양해 부탁드립니다. 다음과 같은 순서로 정리해보고자 합니다. 1. 개요, 장내 미생물와 숙주 면역계 간의 상호작용에 대하여 (+ 항생제의 위험성) 2. 질병과 장내미생물 : 당뇨병, 감염 및 염증성 질환, 암, 자가면역질환, 만성신장질환, 뇌질환 3. 장.. 더보기
[47일차] 생물정보학 입문 책 정리 ch.03-2 :: 인생의 전경, 16S rRNA 시퀀싱 안녕하세요, 오늘은 저번 글에 이어 '생물정보학 입문 책' 챕터 3 나머지 부분을 정리해보도록 하겠습니다. 전 글에서 말했듯 '수평적 유전자 전달'에 대한 내용부터 시작하겠습니다.   [46일차] 생물정보학 입문 책 정리 ch.03-1 :: 인생의 전경, DNA와 RNA, 그리고 단백질의 이야기안녕하세요, 이번 글에서는 '생물정보학 입문' 책의 두번째 챕터에 이어 세번째 챕터를 정리해보고자 합니다. 세번째 챕터는 이전 챕터보다 굉장히 길더군요.    [43일차] 생물정보학 입문 책tkmstudy.tistory.com  일반적으로, 수평적 유전자 전달은 복제 또는 교배 중에 부모로부터의 후손이 아닌 다른 수단을 통해서, 실험실 절차가 아닌 자연적인 방법을 통해서, 한 유기체가 다른 유기체로부터 유전물질을 .. 더보기
[46일차] 생물정보학 입문 책 정리 ch.03-1 :: 인생의 전경, DNA와 RNA, 그리고 단백질의 이야기 안녕하세요, 이번 글에서는 '생물정보학 입문' 책의 두번째 챕터에 이어 세번째 챕터를 정리해보고자 합니다. 세번째 챕터는 이전 챕터보다 굉장히 길더군요. [43일차] 생물정보학 입문 책 정리 ch.02 :: 유전학에서 게놈까지안녕하세요, 이번 글에선 저번 챕터 1에 이어 '생물정보학 입문' 책 챕터 2를 정리해보고자 합니다. [41일차] 생물정보학 입문 책 정리 Ch. 01 :: 서론안녕하세요 이번 글에선 최근에 공부하고 있tkmstudy.tistory.com 우리 몸은 다양한 기능을 하는 세포들의 상호작용으로 어쩌다 보니 '생존'이 가능하게 된 복잡한 시스템입니다. 그러한 몸 안에서 각 세포들은 'DNA'라는 유전 정보로부터 다양한 단백질들을 만들어내고, 그렇게 만들어진 단백질들의 활동은 조화.. 더보기
[45일차] single cell RNA sequencing 기술 프로세스 정리 02 :: 시퀀싱 데이터 전처리 및 다운스트림 분석 안녕하세요, 이번 글에서는 저번 글에 이어 단일세포 전사체 분석 기술의 프로세스를 정리해보도록 하겠습니다.   [44일차] 단일세포 전사체 분석 기술 개요 및 프로세스 정리 01 :: sequencing library 준비 및 구축, illum안녕하세요, 이번엔 단일세포 전사체 분석 기술(single cell RNA-seq analysis)의 전반적인 개요와 고려사항들을 정리해보는 시간을 가져보고자 합니다. 공부 겸 정리하는 건지라 오류가 있을 수 있다는tkmstudy.tistory.com  저번엔 데이터 분석을 위한 준비 절차였다면, 이번엔 본격적으로 데이터를 전처리하고 분석하는 절차로 보면 되겠습니다. 참고자료는 뒷부분에 적어두었으며, 딥리서치와 논문 'The Workflow for Computati.. 더보기
[44일차] 단일세포 전사체 분석 기술 개요 및 프로세스 정리 01 :: sequencing library 준비 및 구축, illumina sequencing 안녕하세요, 이번엔 단일세포 전사체 분석 기술(single cell RNA-seq analysis)의 전반적인 개요와 고려사항들을 정리해보는 시간을 가져보고자 합니다. 공부 겸 정리하는 건지라 오류가 있을 수 있다는 점 양해부탁드립니다.    우선 '단일세포 전사체 기술(scRNA-seq)'이 무엇인지 간단히 소개하겠습니다. scRNA-seq이란, 조건별(ex. disease, chemical treatment, genetic modification)로 등장하는 세포의 구성 및 기능 차이를 개별세포수준에서 파악할 수 있는 기술이라고 볼 수 있겠습니다. 본 기술을 통해 저희는 특정 질병의 중증도를 높이는데 어떤 기능(ex. 경로)을 담당하는 세포 유형(혹은 아형)이 관여하는지 예측할 수도 있고, 특정 조직.. 더보기

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