본문 바로가기

생물정보학(바이오인포매틱스)

[대학원 준비 8일차] SNPs(single-nucleotide polymorphisms)에 대하여 오늘은 translation 관련 이론 복습 전에 제 졸업논문과 관련한 SNPs(single-nucleotide polymorphisms) 개념에 대해 정리해보는 시간을 가져보겠습니다. SNPs에 대해 소개하는 여러 영상을 봤는데, 아래 영상이 기초적인 부분부터 SNPs가 무엇인지 잘 설명해주는 것 같습니다.   NAVER 지식백과1)에 따르면, SNPS는 개인마다 DNA 염기서열에서 하나의 염기서열에 차이를 보이는 유전적 변화 또는 변이(a variation at a single position in a DNA sequence among individuals)로 사람 유전체 중엔 300~1000만의 SNPs가 있다고 합니다. 또한, 1% 이상의 집단이 DNA sequence의 specific posti.. 더보기
[대학원 준비 7일차] CRISPR-Cas9 system, NHEJ(non-homologous end joining), HDR 안녕하세요 이번 글에선 CRISPR-Cas9에 대해 정리해보는 시간을 가져보겠습니다. 우선 배경지식을 설명하자면, 많은 bacteria의 genome엔 bacteriophage viruses의 DNA로부터 유래된 sequences와 동일한 short DNA segements를 repeated DNA sequence에 의해 구분된 array 내부에 포함하는데, 이것은 뒤에도 설명하겠지만 적응성 면역을 위한 절차입니다. 여기서 repet loci를 Clustered Regulatory Interspaced Short Palindromic Repeats(CRISPR)라고 하며, CRISPR에서 전사가 이루어져 crRNA(CRISPR RNA)가 만들어지게 됩니다. 이 crRNA와 trancrRNA가 sgRNA를.. 더보기
[대학원 준비 7일차] RNA interference(RNAi)를 위한 siRNA(single interfering RNA), miRNA 오늘은 6일차에 정리한 RNA splicing에 이어, RNA interference에 대해 정리해보는 시간을 가져보겠습니다. [대학원 준비 6일차] mRNA splicing, Exonic splicing enhancers(ESEs), 그리고 self-splicing오늘은 전에 5' capping과 3' tailing으로 만들어진 pre-mRNAs가 mature mRNAs가 되기 위해 필요한 RNA splicing 절차에 대해 소개해보도록 하겠습니다. [대학원 준비 5일차] transcription in eukaryotes, 5' methyIguanotkmstudy.tistory.com RNA interference는 작은 RNA 조각이 mRNAs에 결합함으로써 타깃으로 하는 protein transla.. 더보기
[대학원 준비 6일차] mRNA splicing, Exonic splicing enhancers(ESEs), 그리고 self-splicing 오늘은 전에 5' capping과 3' tailing으로 만들어진 pre-mRNAs가 mature mRNAs가 되기 위해 필요한 RNA splicing 절차에 대해 소개해보도록 하겠습니다.   [대학원 준비 5일차] transcription in eukaryotes, 5' methyIguanosine cap(5' capping)과 3이번엔 rRNA, tRNA에 이어 mRNA의 합성과 프로세스 과정에 대해 살펴보겠습니다. [대학원 준비 5일차] 이론 복습 :: U20 snoRNA, U68 snoRNA, 그리고 tRNA(transfer RNA)오늘은 4일 차 글에 이어 Transcription 관련 이tkmstudy.tistory.com  우선 RNA splicing은 간단히 말해, pre-mRNAs의 In.. 더보기
[대학원 준비 5일차] transcription in eukaryotes, 5' methyIguanosine cap(5' capping)과 3 이번엔 rRNA, tRNA에 이어 mRNA의 합성과 프로세스 과정에 대해 살펴보겠습니다. [대학원 준비 5일차] 이론 복습 :: U20 snoRNA, U68 snoRNA, 그리고 tRNA(transfer RNA)오늘은 4일 차 글에 이어 Transcription 관련 이론 복습을 해보도록 하겠습니다. [대학원 준비 4일차] 이론 복습 :: transcription in bacteria, rRNA preprocessing이번 글에서는 전 글에 이어 전공 수업 때 배운 tkmstudy.tistory.com 전에 bacteria에서 mRNAs가 합성되는 절차를 다뤘던 것 같은데, 이번엔 RNA polymerase II에 의해 진핵생물에서 mRNAs가 합성되는 절차를 설명해보겠습니다. 우선, RNA po.. 더보기
[대학원 준비 5일차] 이론 복습 :: U20 snoRNA, U68 snoRNA, 그리고 tRNA(transfer RNA) 오늘은 4일 차 글에 이어 Transcription 관련 이론 복습을 해보도록 하겠습니다.  [대학원 준비 4일차] 이론 복습 :: transcription in bacteria, rRNA preprocessing이번 글에서는 전 글에 이어 전공 수업 때 배운 'Transcription' 관련 이론 복습을 해보려고 하는데 먼저 bacteria의 Transcription 과정을 정리해보겠습니다.    [대학원 준비 4일차] 이론 복습 :: RNA polymtkmstudy.tistory.com  우선, U20 snoRNA가 어떻게 methylation을 유도하는지 그림을 그려봤습니다.   설명하자면, pre-rRNA의 metylated nucleotide(CH3있는 곳)가 snoRNA와 수소결합을 형성하며,.. 더보기
[대학원 준비 4일차] 이론 복습 :: transcription in bacteria, rRNA preprocessing 이번 글에서는 전 글에 이어 전공 수업 때 배운 'Transcription' 관련 이론 복습을 해보려고 하는데 먼저 bacteria의 Transcription 과정을 정리해보겠습니다.    [대학원 준비 4일차] 이론 복습 :: RNA polymerase에 의한 transcription process들어가기 전에 우선 Eric Chow라는 분이 NGS methods에 대해 잘 설명해주시는 것 같아서 아래 설명 영상도 어제 저녁에 봤는데, NGS(next generation sequencing)란 무엇이고 어디에 적용될 수 있는지 overview가tkmstudy.tistory.com  RNA polymerase는 우선 5개의 subunits이 core enzyme을 형성하는데, 이 효소는 accessory.. 더보기
[대학원 준비 4일차] 이론 복습 :: RNA polymerase에 의한 transcription process 들어가기 전에 우선 Eric Chow라는 분이 NGS methods에 대해 잘 설명해주시는 것 같아서 아래 설명 영상도 어제 저녁에 봤는데, NGS(next generation sequencing)란 무엇이고 어디에 적용될 수 있는지 overview가 궁금하신 분들은 보시면 큰 도움이 되실 것 같습니다. 결국 gene expression level을 확인하는 것은 tumor cell이 유전 정보를 혈액으로 보내는 만큼 tumor의 gene expression이 발견되는지 혹은 외부 병원균(SARS-CoV-2 등)이 몸에 침투했는지, gene에 mutation이 발생했는지 등을 확인하여 질병 치료 및 예방에 도움을 줄 수 있을 것입니다. 이를 IIMUNIA 보고서1)에서 한 줄로 잘 설명해주었습니다.. 더보기

티스토리툴바